หลักสูตรปริญญาโท (หลักสูตร 2 ปี)
• วท.ม.(เทคโนโลยีและการจัดการสิ่งแวดล้อม) : M.S.(Environmental Technology and Management)
• วท.ม.(วิทยาศาสตร์สิ่งแวดล้อม) : M.S.(Environmental Science)

หลักสูตรปริญญาเอก (หลักสูตร 3 ปี)
• ปร.ด.(เทคโนโลยีและการจัดการสิ่งแวดล้อม) : Ph.D.(Environmental Technology and Management)
• ปร.ด.(วิทยาศาสตร์สิ่งแวดล้อม) : Ph.D. (Environmental Science)

หลักสูตรปริญญาโทควบเอก (หลักสูตร 5 ปี)
• ภาควิชาเทคโนโลยีและการจัดการสิ่งแวดล้อม : Ph.D. (Environmental Technology and Management)
• ภาควิชาวิทยาศาสตร์สิ่งแวดล้อม : Ph.D. (Environmental Science)

ทุนการศึกษาระดับบัณฑิตศึกษา
1. ทุนบัณฑิตวิทยาลัย มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์
2. ทุนการศึกษาสำหรับนิสิตคณะสิ่งแวดล้อม
– ทุนสำหรับนิสิตคณะสิ่งแวดล้อมศึกษาต่อระดับบัณฑิตศึกษาคณะสิ่งแวดล้อม
– ทุนวิจัยเพื่อพัฒนาบัณฑิตศึกษาคณะสิ่งแวดล้อม
– ทุนวิจัยจากภาควิชา